وافقت الحكومة علي إسناد الجزء الأول من مشروع إعداد وتصميم الرسومات التنفيذية لمباني المرحلة الأولي من مشروع الجامعة المصرية اليابانية بالاتفاق المباشر للمكتب الياباني "إيسوزاكي أوكاه" بمبلغ 2 مليون و398 ألفًا و448 دولارًا في ضوء ما أبده الدكتور مصطفي مسعد وزير التعليم العالي. وعلمت "بوابة الأهرام" أن وزير التعليم العالي كان قد تقدم بمذكرة لمجلس الوزراء في اجتماعه الأخير برئاسة الدكتور هشام قنديل يطلب فيها الموافقة علي إسناد إعداد وتصميم الرسومات التنفيذية لمباني المرحلة الأولي من مشروع الجامعة المصرية اليابانية بالاتفاق المباشر للمكتب الياباني المشار إليه بمبلغ 10 ملايين و622 ألفًا و485 دولار. يذكر أنه تم توقيع أنه تم توقيع اتفاق بين حكومتي مصر واليابان في 26 سبتمبر 2009 لتأسيس الجامعة المصرية اليابانية للعلوم والتكنولوجيا، بهدف بناء قدرات الموارد البشرية وتنميتها في مجال العلوم والتكنولوجيا في مصر وذلك من خلال ادخال مناهج التعليم والبحث والتدريب اليابانية وبالتالي المساهمة في تحسين الروابط الاقتصادية والعلمية بين البلدين. وألزمت الاتفاقية مصر بتخصيص مساحة 200 فدان في مدينة برج العرب الجديدة بالإسكندرية لإنشاء المباني والتجهيزات لمزاولة نشاط الجامعة. وصدر قرار جمهوري رقم 149 لسنة 2009 بالموافقة علي الاتفاقية، وبتاريخ 27 يناير 2010 تم تشكيل مجلس أمناء الجامعة اليابانية برئاسة الدكتور يسري الجمل وزير التربية والتعليم الأسبق وعضوية 7 أعضاء،وبتاريخ 9 مايو 2011 صدر قرار رئيس المجلس الأعلى للقوات المسلحة رقم 8/2011 بإنشاء الجامعة المصرية اليابانية للعلوم والتكنولوجيا. ونفاذا لتلك الاتفاقية وشروطها أعلنت الحكومة المصرية عن مسابقة معمارية بين المكاتب الاستشارية المتخصصة في تصميمي الجامعات في كل من مصر اليابان وتم تشكيل لجنة تحكيم من الخبراء المتخصصين في كل من مصر واليابان لاختيار أفضل مشروع من بين المكاتب الاستشارية المشاركة في المسابقة المعمارية والتي تنص في شروطها علي أن يقوم الفائز الأول في المسابقة بتقديم التخطيط والتصميم المعمارية لمنشآت مقر الجامعة الجديد، وفاز بالجائزة الأولي في المسابقة المعمارية المكتب الياباني "أيسوزاكي أوكاي" ومشاركوه وتم اعتماد نتيجة المسابقة. وقدم المكتب الياباني الفائز مسودة التعاقد مع الحكومة التي تضمنت نطاق أعمال المكتب الياباني إعداد التصميمات والرسومات التنفيذية ومستندات الطرح والإشراف علي التنفيذ لجميع التخصصات الهندسية لكل من موقع الجامعة ومباني المرحلة الأولي من المشروع وذلك عن حجم أعمال إنشائية بقيمة تقديرية خمسة وسبعون مليون دولار أمريكي، وطلب اتعاب استشارية عن تلك الأعمال مبلغ وقدرة 10 ملايين و 622 ألفا و 485 دولار. كما علمت "بوابة الأهرام" أن الجانب الياباني عبرعن قلقه من تأخر الجانب المصري في التوقيع علي عقد إنشاء مباني الجامعة بدون سبب مقنع، حيث تعتبر الجامعة المصرية اليابانية للعلوم والتكنولوجيا هي المشروع الأول من نوعه لإنشاء جامعة تكنولوجية يابانية خارج اليابان علي الإطلاق، وينظر الجانب الياباني لهذا المشروع باعتباره مشروعًا علميًا رائدًا مهمًا يتعلق مباشرة بصورة اليابان في الخارج، وتعتبره أهم مشروعات التعاون المستقبلي مع مصر واحد الروابط المتميزة والفريدة لعلاقته معها. وبناء علي ذلك أصدر مجلس الوزراء قراره المتقدم في ضوء ما أبداه الدكتور وزير التعليم العالي في الاجتماع.