أكد الدكتور أحمد خيري رئيس الجامعة المصرية اليابانية للعلوم والتكنولوجيا أن الجامعة التزمت منهجا مؤسسيا وشفافا لاختيار النواب ووضع نظام من خلال لجنة مشتركة من الجانبين المصري والياباني، ومعايير للوظائف الثلاث لاختيار نواب رئيس الجامعة، وتحديد قائمة مختصرة من 3 أفراد لكل وظيفة بالجامعة. وأوضح أن هناك لجنة أخري تقوم باجراء المقابلات لشغل الوظيفة وتم اختيار 9 من المتقدمين منهم 5 من خارج مصر، وهم اساتذة مصريون بالجامعات الأمريكية والإدارية، و4 من الداخل واختيار واحد فقط كان يعمل كأستاذ بالجامعة ولم يشغل وظيفة نائب والآخران أحدهما مقيم في امريكا ويعمل بأحد جامعتها المرموقة، والآخر لم يكن له صلة بالجامعة وكان عميدا لإحدي كليات جامعة الإسكندرية.