ألقت أزمة السياحة بظلالها على مصر للطيران وكبدتها خسائر تعدت 4 مليارات جنيه ولهذا السبب شكّل اللواء وائل المعداوى وزير الطيران المدنى لجنة اقتصادية لتقليص الخسائر وتعويضها. وأوضحت اللجنة فشل خط أوزاكا وطوكيو باليابان بعد أشهر معدودة على تشغيله. وصرح الطيار توفيق عاصى رئيس الشركة القابضة لمصر للطيران بأنه يوجد خطوط تُحقق خسائر عالية ولا تساهم فى تغذية باقى شبكة الخطوط وبالذات خطوط طوكيو وأوزاكا باليابان، كما تُشير الدراسة التى أعدتها إلى وجود اتجاه قوى لإيقاف هذه الرحلات فى ظل النزيف المستمر من الخسائر، كما أن هناك خطوطا أخرى لمناطق متعددة تحقق خسائر ولكن بحساب تأثيرها على شبكة مصر للطيران فإنها تُحقق فائض إيجابى للشبكة ككل هذا فى الوقت الذى صرح فيه الطيار رشدى زكريا رئيس شركة مصر للطيران للخطوط الجوية أن ايقاف الرحلات إلى طوكيو وأوزاكا باليابان بسبب الخسائر المتزايدة وانتهاء دعم وزارة السياحة لتشغيل الخطين ورغم هذا قررت مصر للطيران زيادة رحلاتها فى الموسم الصيفى الجديد 2013 بنسبة 16% مقارنة بالموسم الصيفى الماضى، حيث قررت تسيير 654 رحلة أسبوعياً مقابل 565 رحلة فى الصيف الماضى، بالإضافة إلى رحلات جديدة وزيادة الترددات على بعض النقاط المهمة، حيث تقرر زيادة رحلات جوهانسبرج وأثينا واسطنبول ولندن ومدريد وميلانو وروما بالإضافة إلى افتتاح 5 خطوط جديدة اعتباراً من شهر يونيه القادم لكل من مانشستر وتورونتو وهرارى والقصيم وأبيدجان.
