أعلنت وزارة الصحة عن أنه يتم رصد فيروسات الأنفلونزا في مصر من خلال عدة برامج بدأت منذ عام 1999، حيث يتم رصد فيروسات الأنفلونزا الموسمية للمرضى المترددين على العيادات الخارجية فى 8 مواقع مختارة تمثل مناطق الجمهورية، بالإضافة الى رصد مرض أنفلونزا الطيور فى جميع أماكن الخدمة الصحية على مستوى الجمهورية منذ يناير 2006. وأوضحت الوزارة أنه تم تطبيق برنامج رصد الأمراض التنفسية الشديدة للحالات المعزولة بالمستشفيات منذ أكتوبر 2007 ويتم تنفيذه فى 8 مواقع مختارة تمثل مناطق الجمهورية. كما تم توسيع نظام رصد نشاط الأنفلونزا للمصابين بأعراض الانفلونزا فى أكثر من 450 مستشفى على مستوى الجمهورية منذ ظهور حالات جائحة انفلونزا A/H1N1 في يونيو 2009 التي عرفت بأنفلونزا الخنازير في ذلك الوقت. كما تم الرصد المعملي لفيروسات الأنفلونزا في المعامل المركزية بوزارة الصحة والسكان و معامل إقليمية على مستوى الجمهورية اثنان بمنطقة الصعيد وثلاثة بمنطقة الوجه البحري. وتابعت الوزارة في بيانها "يتم متابعة التحور الجينى لفيروسات الأنفلونزا على المستوى القومى والاقليمي والعالمي وعمل الدراسات والمسوحات الصحية للأنفلونزا". كما أعلنت الوزارة عن أن نسبة حالات الإلتهاب التنفسى الحاد والالتهاب الرئوى المكتشفة والمبلغه من المستشفيات على مستوى الجمهورية خلال موسم شتاء 2013/2014 الفترة من أكتوبر 2013 حتى الأسبوع الأول من يناير 2014 متقاربة مع نسبة الحالات في نفس الفترة الزمنية من موسم شتاء 2012/2013 وتتراوح بين (0.2-0.3%) من إجمالى عدد مترددين حوالى 41 مليون متردد على العيادات الخارجية والاسنقبال. واضافت "أنواع فيروسات الأنفلونزا الشائعة والأكثر انتشاراً على المستوى القومى هي فيروس الأنفلونزا A/H1N1pdm09 (المعروف سابقا بانفلوانزا الخنازير والذى اصبح ضمن انواع الأنفلونزا الموسمية) بنسبة 11.6%، يليه فيروس الأنفلونزا الموسمية من نوع (A/H3) بنسبة 8.2%، ثم فيروس الأنفلونزا الموسمية من نوع (FluB) بنسبة 4.5%".
