كشفت وزارة التخطيط والمتابعة والاصلاح الاداري حجم الاستثمارات المخصصة لهيئة الطاقة الذرية بخطة العام المالي 17/2018 التى بلغت نحو 57 مليون جنيه، منها 52 مليون جنيه استثمارات حكومية. وتتمثل أهم مشروعات الهيئة - وفقا لتقرير خطة التنمية متوسطة المدى "2017-2020" - في تطويرالمعامل الإنتاجية بمركز البحوث النووية، وتطوير مفاعل مصر البحثي الثاني بقدرة 22 ميجاوات، وتطوير وحدة علاج الأورام بالإشعاع، ومشروعات وحدات تشعيع الأغذية بمركز تكنولوجيا الاشعاع. وتشمل مشروعات هيئة الطاقة الذرية تطوير معجل السيكلوترون، وبرامج الطوارئ الإشعاعية، والميكنة الآلية لهيئة الطاقة الذرية المصرية.