استكمالاً لمسلسل العنف والإرهاب بدأت جماعة الإخوان المحظورة في تنفيذ مخطط تخريب الجامعات المصرية بالتزاماً مع محكمة الرئيس المعزول محمد مرسي, حيث شهدت الجامعات المصرية أعمال عنف من قبل طلاب المحظورة حيث قاموا باقتحام المقر الاداري لجامعة الأزهر وحملوا الاسلحة البيضاء مما دعي رئيس الجامعة لاستدعاء قوات الأمن للسيطرة علي الموقف وشهدت جامعة عين شمس، وقفة احتجاجية من طلاب المحظورة وقاموا برسم الجرافيتي علي جدران الكلية، للمطالبة بالإفراج عن الطلاب المعتقلين. وفي جامعة حلوان شهدت تظاهرات بين الطلاب المنتمين للمحظورة والطلاب المؤيدين للجيش نشبت علي اثرها اشتباكات بالأيدي بين طلاب الإخوان المسلمين، والطلاب المؤيدين للجيش والحال لا يختلف كثيرا في جامعة القاهرة, حيث شهد مبني القبة داخل الحرم الجامعي بجامعة القاهرة اعمال عنف, وذلك بعد أن هجم طلاب الإخوان علي الطلاب المؤيدين المتظاهرين أمام مبني القبة، لاحتلال مكان تظاهرتهم، للتظاهر فيه. ونجح الأمن الإداري بالجامعة في فض الاشتباكات، ووضع الحواجز الحديدية بين المسيرتين, فيما أغلق الأمن الأبواب الرئيسية للقبة.وفي جامعة المنوفية عقد رئيس جامعة المنوفية، جلسة طارئة لمجلس الجامعة بحضور محافظ المنوفية، لبحث تداعيات أحداث اقتحام مجموعة من أعضاء هيئة التدريس والهيئة المعاونة المنتمين لجماعة الإخوان المسلمين لمكتبه رافعين بعض اللافتات والشعارات المسيئة للجيش والدولة. وقررمجلس الجامعة إحالة '16 'عضو هيئة تدريس وهيئة معاونة بالجامعة، إلي التحقيق طبقاً لنص المادة رقم ' 106 ' من قانون تنظيم الجامعات رقم ' 49 ' لسنة 1972، وبالإضافة لإيقافهم عن العمل لمدة ثلاثة شهور مع وقف صرف ربع رواتبهم من تاريخ الإحالة إلي التحقيق وعرض أمر إيقاف المرتب بعد شهر إلي مجلس التأديب لاتخاذ قراره بشأن وقف الصرف. كما قرر مجلس الجامعة اتخاذ الإجراءات اللازمة من قبل الجامعة للحفاظ علي ممتلكاتها وحسن سير العملية التعليمية بها، بغية الحفاظ عن القيم والتقاليد والأعراف الجامعية. يذكر أن عددا من أعضاء هيئة التدريس تظاهر أمس أمام مكتب رئيس الجامعة رافعين بعض اللافتات والشعارات المسيئة للجيش.. وبعد نشوب اشتباكات مع عاملين بالجامعة اقتحموا مكتب رئيس الجامعة وأتلفوا بعض محتويات المكتب.. تم تحرير محضر بالواقعة, كما تشهد جامعة الزقازيق اشتباكات عنيفة بين طلاب مستقلين، وطلاب جماعة الإخوان المحظورة، أمام كلية التجارة.وحالة من الكر والفر بينهما، حيث تحولت ساحة جامعة الزقازيق وأمام مبني رئاسة الجامعة لحرب شوارع بين طلاب الجماعة المحظورة والطلاب المستقلين.حيث قام الطلاب من مؤيدي الجيش بفض مسيرة لطلبة أعضاء 'المحظورة' ما تسبب في حدوث اشتباكات بين الجانبين استخدم فيها بعض الطلاب السيوف والشوم والخرطوش.