تتبع موانيء البحر الأحمر إجراءات صارمة للكشف على البضائع الواردة لموانيها وكذا الصادرة منها حيث قام اللواء بحري " حسن فلاح " رئيس الهيئة بتفقد الإجراءات المتبعة وذلك بالتنسيق مع الشرطة و الجمارك و من خلال وضع منظومة عمل متكاملة للتفتيش على البضائع الواردة والصادرة لموانيها و كانت الهيئة قد زودت موانيها بأجهزة حديثة للكشف على البضائع و ذلك حماية لأمن البلاد .