تراجعت هيئة الأوقاف من المراكز الأولى فى تصنيف الفساد إلى المركز الأخير بين الهيئات التى تحارب الفساد. وأكدت وزارة الأوقاف أنها لم ولن تتستر على أى فساد مالى أو إدارى مهما كانت درجة ومكانة من صدر منه، وأن الوزارة خصصت خطًا ساخنًا للإبلاغ عن أى شكاوى تتعلق بالفساد أو المخالفات الإدارية وهو:- (23960606). ويجرى التنسيق بين وزارتى العدل والأوقاف للتوعية بمخاطر الفساد والعمل على مواجهته. وقد أشاد مركز النزاهة والشفافية بتخصيص الأوقاف خطبة عن خطورة الرشوة والمحسوبية وتعميمها على جميع مساجد الوزارة.