أعلن العديد من زعماء الكنيسة الأرثوزكسية عن تأييدهم لترشح قائد الانقلاب عبدالفتاح السيسي وزير الدفاع لرئاسة مصر، كما صدر ترحيب مماثل من القس أندريه زكي، نائب رئيس الطائفة الإنجيلية ومدير الهيئة القبطية الإنجيلية للخدمات والذي قال: "إن خطاب المشير السيسى كان خطابا مدنيا قدم ملامح مصر التي نريدها، وبه أيضا رغبة للتحرك نحو المستقبل". وأضاف زكي أن "الخطاب جاء يلبي رغبة جماهيرية حاشدة، واتسم بقراءة نقدية للحظة الراهنة لواقع مصر، وقدم ملامح أولى نحو أهمية إعادة بناء الدول، وأهمية الإنتاج من أجل التنمية الاقتصادية، ودور مؤسسات الدول، واحتوى على الإيمان العميق بالله". ومن جهته، قال الأب رفيق جريش مدير المكتب الصحفي بالكنيسة الكاثوليكية، إن الكنيسة تخضع لإرادة الشعب مهما يكن الذي يختاره، ونتمنى النجاح لمن تختاره الإرادة الشعبية. وأكد جريش، فيما نقلته عنه جريدة "اليوم السابع" الخميس، أن 30 يونيو ثورة شعبية حماها الجيش، والآن صوت الشعب أعلى، والقوات المسلحة تخضع للإرادة الشعبية، ونحن نثق بوجود انتخابات نزيهة تكون فيها الكلمة للشعب، مؤكدا أن كل ما أشار له خطاب المشير السيسى جيد، بحسب تعبيره. ونقل "اليوم السابع" عن مينا مجدي منسق اتحاد شباب ماسبيرو أيضا قوله: "من حق أي مواطن الترشح للرئاسة، والسيسي مواطن مصري من حقه الترشح، فنحن لن ننتخبه فقط من أجل دوره في 30 يونيو، وإنما لا بد من وجود برنامج انتخابي واضح ومحدد"، حسبما قال. ومن جهته، قال الدكتور القس أكرام لمعي، رئيس المجمع الأعلى للكنيسة الإنجيلية المشيخية بمصر، إنه يؤيد ترشيح المشير عبدالفتاح السيسي لرئاسة الجمهورية في هذه المرحلة الحرجة والحساسة لمصر، ويثق في قدرته على الانتقال من هذه المرحلة إلى الأمن والأمان والاستقرار في مصر، وأنه يثق في سيره نحو تنفيذ خارطة الطريق للانتقال من مصر الديكتاتورية، إلى الدولة التي تسودها الديمقراطية والمدنية الحديثة المعاصرة. وهنأ القس حلمي قادس راعي الكنيسة الإنجيلية المشيخية ببورسعيد، عبدالفتاح السيسي لترقيته وترشحه من قبل المجلس الأعلي للقوات المسلحة لرئاسة البلاد. وقال: "أؤيد مع جموع الشعب المصري المشير لقيادة بلادنا العزيزة مصر، في مواجهة التحديات التي تواجهها مصر في هذه الفترة". وأضاف: "أثق أنه أفضل رجل لهذا المنصب في هذه المرحلة". وكان القس متى ساويرس قال في تصريحات عقب إقرار الدستور الأخير: "الدستور رجع مصر لينا، ونطالب السيسي بالترشح للرئاسة"، فيما قال القس بوليس عوضة أستاذ القانون الكنسي: "السيسي هياخد الرئاسة بالتزكية، وليس بالانتخابات"، وقال القس رفعت فكري راعي الكنيسة الإنجيلية بشبرا، إن "السيسي مواطن مصري يحق له الترشح ما دامت تنطبق عليه الشروط". وكان بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية تواضروس الثاني صرح في حوار مع جريدة "الوطن" الكويتية قبل أيام، بأن مشاركة المشير عبدالفتاح السيسي في الانتخابات الرئاسية واجب وطني، زاعما أن المصريين يرونه منقذا، وبطل ثورة 30 يونيو.