يتحدث البعض عن مصطلح "الدولة العميقة" وتجذره في مفاصل الدولة، وفيما يشبه الخيال وضمن حلقات الفساد الإداري في وزارة الصحة، حصلت "المصريون" على مستند يؤكد تورط وزارة الصحة في التستر على مخالفات ارتكبها وكيل الوزارة في محافظة بني سويف. ونضع المستند وكافة وقائعه على مكتب الدكتور هشام قنديل، رئيس مجلس الوزراء والدكتور محمد مرسي رئيس الجمهورية، لاتخاذ اللازم. ويفيد المستند بأن الوزارة ممثلة في المجالس الطبية المتخصصة شكلت لجنة رفيعة المستوى للتحقق من شكوى تقدم بها مدير القومسيون الطبي بالمحافظة، الدكتور نبيل حلمي، ضد وكيل الوزارة، الدكتور عاطف عافية. وقد تم تشكيل اللجنة وذهبت إلى المحافظة في يوم 26 ديسمبر من عام 2012م، وتكونت من الدكتور حيضر سلطان والدكتور أحمد عبد العاطي، عضوى المجالس الطبية المتخصصة، وعاطف صابر، عضو الشئون القانونية بالمجالس الطبية المتخصصة. وتوصلت اللجنة في تقريرها الذي عرضته على مدير عام المجالس الطبية المتخصصة إلى أن عاطف عافية خالف في تشكيل لجان التظلم، واستبعد مدير القومسيون الطبي بالمخالفة للقانون. وأكدت اللجنة أن وكيل الوزارة لم يوفر مديرا ماليا للقومسيون الطبي، مما يخالف القانون ويعرض موارد القومسيون للهدر، كما أن وكيل الوزارة خالف اللائحة المالية الخاصة بالمخدرات. ولم يحرك وزير الصحة ومدير عام المجالس الطبية ساكنا تجاه هذا التقرير، مما أعطى انطباعا بتستر المسئولين الكبار على مخالفات وكيل الوزارة لأسباب سياسية. وقد قام الأطباء بمحاصرة استراحة عافية على كورنيش النيل وأعلنوا اعتصامهم مطالبين بإقالته.