نفى الرئيس الإسرائيلي، شمعون بيريس، أي صلة لإسرائيل بحادث اغتيال العالم الإيراني أحمد مصطفى روشن، في الوقت الذي اتهم فيه الزعيم الديني لإيران على خامينائي كلًا من الموساد الإسرائيلي والمخابرات المركزية الأمريكية بأنهما وراء أحداث اغتيال العلماء الإيرانيين. ونقلت صحيفة معاريف، مقاطع من الخطاب الذي أرسله خامينائي لأسرة العالم الإيراني، حيث أكد لهم أن هذا الحادث من تخطيط الولاياتالمتحدة وإسرائيل اللتين اعتادتا قتل العلماء الإيرانيين في الفترة الأخيرة. وأوضحت الصحيفة، أنه تم نشر الخطاب على الموقع الخاص بخامينائي الذي أوضح أن المشروع النووي الإيراني لن يتوقف على أشخاص بعينهم، وعلى الرغم من تكرار حوادث الاغتيال فسوف تستمر الخطة الإيرانية. كان أحمد مصطفى روشن، أحد كبار علماء المشروع النووي الإيراني قد لقي مصرعه، بعد أن وضع أحد الأشخاص قنبلة داخل سيارته انفجرت فور محاولته استقلالها.