يعد التعاون الثنائي مع دول حوض النيل أحد المحاور الرئيسية فى السياسة المصرية الخارجية، بتوجيهات من الرئيس عبد الفتاح السيسى ويعتبر جزءاً أساسياً في الاستراتيجية المصرية للتحرك مع دول حوض النيل. ويعتبر توافر الإمكانيات البشرية، والخبرات الفنية والمؤسسية أحد أهم عوامل نجاح أنشطة التعاون المصري الثنائي. ومن ثمّ عملت وزارة الموارد المائية والري على تنمية علاقاتها الثنائية مع مختلف دول القارة خاصة دول حوض النيل، وتوظيف وزارة الموارد المائية والري لخبراتها وإمكانياتها في دعم هذا التوجه ولخدمة الدول الأفريقية الشقيقة في كافة المجالات المتعلقة بالموارد المائية. وقامت وزارة الموارد المائية والري بالعديد من النجاحات في ملف مشروعات التعاون الثنائي مع الدول الأفريقية ودول حوض النيل بصفة عامة من خلال تنفيذ مشروعات تنموية تعود بالنفع المباشر على مواطني حوض النيل ومنها الأهداف الإستراتيجية للتعاون الثنائي في مجال الموارد المائية. وكان لدور مصر تجاه دول القارة الإفريقية ودول حوض النيل بشكل خاص، فى دعم وترسيخ العلاقة التاريخية بين مصر ودول القارة ، والاستفادة من أوجه التعاون والدعم التنموي والفني المقدم خاصة لدول حوض النيل في تحقيق أمن مصر القومي خاصة في دول حوض النيل. وفى هذا الاطار بدات وزارة الرى والموارد المائية بالفعل فى مشروعات التعاون الفني الثنائي مع دول حوض النيل بين وزارتى الموارد المائية والري في مصر وجنوب السودان ، وبناءاً على مذكرة التفاهم بين وزارتي الموارد المائية والري في مصر وجنوب السودان والتي تم توقيعها في 8 أغسطس 2006، يجرى حالياً تنفيذ حزمة من مشروعات التنمية بجنوب السودان في مجال الموارد المائية بمنحة مصرية وقد تم تعزيز مذكرة التفاهم من خلال بروتوكول التعاون الفني بين وزارتي الموارد المائية والري بالبلدين والذي تم توقيعه في 28 مارس 2011 بجوبا، ثم اتفاقية التعاون الفني والتنموي التى تم توقيعها بالقاهرة فى 22 نوفمبر 2014. « أربعة سدود» وعن مشروع إنشاء أربعة سدود حصاد مياه أمطار / حفائر تم توقيع مذكرة تفاهم للمشروع إنشاء 4 سد حصاد مياه أمطار / حفائر في نوفمبر 2016 بهدف الاستفادة من مياه الأمطار وتخزينها للاستفادة منها في الشرب و الثروة الحيوانية والاستخدامات المنزلية. وجارى البدء في تنفيذ المرحلة الأولى لإنشاء 2 سد حصاد مياه أمطار في مدينة تونج وجوجريال بسعة 30 ألف متر مكعب للسد الواحد لتوفير مياه الأمطار في أوقات الجفاف للشرب والاستخدامات المنزلية وللثروة الحيوانية. اما بالنسبة الى المرحلة الثانية من المشروع (إنشاء 2 سد حصاد مياه أمطار/ حفائر) فجارى التنسيق مع الجانب الجنوب سوداني لتنظيم زيارة ميدانية الى ولاية شرق الاستوائية لاختيار المواقع المقترحة بإقليم كيبوتيا الكبرى وجمع البيانات والمعلومات اللازمة لطرح عملية تنفيذ هذه المرحلة. " سد واو " وعن مشروع دراسة الجدوى الفنية والاقتصادية لسد واو المتعدد الأغراض تم الانتهاء من إعداد دراسات الجدوى الفنية والاقتصادية لمشروع سد واو المتعدد الأغراض لتوفير حوالى 2مليار م3 ولتوليد 10.4 ميجا وات بالاضافة الى توفير مياه الشرب لحوالى 500 الف نسمة والاستفادة من المياه فى الرى التكميلي لحوالى 30-40 الف فدان مما يتيح فرصة للاستثمار الزراعي في جنوب السودان، وتم تسليمها الى الجانب الجنوب سوداني في فبراير 2015، تم تنظيم ورشة عمل فنية لتقديم دراسات الجدوى النهائية (المياه والطاقة) للمجتمعات والسلطات المحلية وغيرها من المنتفعين في ولاية غرب بحر الغزال. وتم انشاء معمل لتحليل نوعية المياه بمدينة جوبا والانتهاء من إنشاء وتسليم المعمل لنوعية المياه وتزويده بالمعدات اللازمة والأجهزة، كذلك تدريب طاقم العمل بالمعمل في عام 2015. ويقوم حالياً بعمل كافة التحليلات لمراقبة نوعية المياه لصالح الجهات الحكومية بجنوب السودان كمعمل معتمد. وعن التدريب وبناء القدرات الفنية فقد تم تنفيذ ما يقرب من 15 دورة تدريبية في مجالات مختلفة من الموارد المائية (إدارة الموارد المائية، نظم المعلومات الجغرافية، ونوعية المياه، .....) لأكثر من 200 متدربا من الكوادر الفنية من جنوب السودان. في المجالات المتعلقة بالموارد المائية والري مثل الإدارة المتكاملة للموارد المائية - تحليل نوعية المياه - طرق قياس المناسيب والتصرفات - نظم المعلومات الجغرافية - إدارة المياه الجوفية. ويحدث بين البلدين زيارات مختلفة حيث تم زيارة الدكتور الوزير ووفد رسمي مرافق الى جنوب السودان خلال الفترة من (8-12) سبتمبر 2020 للتباحث حول سبل تعزيز التعاون الثنائي بين الدولتين في مجال الموارد المائية والرى وتم عقد عدد كبير من اللقاءات مع المسئولين بحكومة جنوب السودان. وتمت زيارة وزير الموارد المائية والرى بجمهورية جنوب السودان ووفد رسمي مرافق الى القاهرة خلال الفترة (18- 30) أكتوبر 2020 للتباحث حول سبل تعزيز التعاون بين البلدين و تنظيم عدد من الزيارات الميدانية لمشروعات البنية التحتية، وزيارة وزير الموارد المائية والرى بجمهورية جنوب السودان ووفد رسمي مرافق الى القاهرة في 15 مارس 2021 للتباحث حول سبل تعزيز التعاون بين البلدين، وتمت زيارة الدكتور وزير الموارد المائية والرى الى جمهورية جنوب السودان خلال الفترة (23-25) يونيو 2021 للتباحث حول سبل تعزيز التعاون بين البلدين.
