بعث السلطان قابوس بن سعيد سلطان عمان برقية عزاء إلى المشير حسين طنطاوى رئيس المجلس الأعلى للقوات المسلحة فى وفاة البابا شنودة، أعرب فيها عن خالص تعازيه ومواساته للشعب المصرى. وقام السفير خليفة بن على بن عيسى الحارثى سفير سلطنة عمان بالقاهرة بزيارة الكاتدرائية المرقسية وتقديم واجب العزاء باسم حكومة سلطنة عمان للأنبا باخوميوس قائم مقام البطريرك، ووصف البابا شنودة بأنه فقيد كل العرب وليس مصر فقط، مشيدا بمواقفه الوطنية.