رفض الدكتور على جمعة مفتى الجمهورية السابق، دعاوى ختان الإناث معتبراً إياها دعاوى غير مستندة للقران والسنة، قائلاً :" الختان بالسنة وبالقرآن فى زماناً هذا مصيبة ألمت بنا والنبى صلى الله عليه وسلم لم يختن بناته". وأشار مفتى الجمهورية السابق فى لقائه ببرنامج "والله أعلم" المذاع عبر فضائية "CBC" ، إلى أن بعض القبائل في المدينة في عهد النبي صلى الله عليه وسلم كانت تختن إناثها، موضحاً أن حديث أم عطية الخاص بختان الإناث ضعيف جدا ولم يرد به سند في السنة النبوية والدليل عدم ختان النبي صلى الله عليه وسلم لبناته. وأوضح أن تغير طبيعة الجو وحياة الإنسان وملبسه جعلت من أمر الختان قضية محرمة بالإجماع، ولكن مصر والسودان والبلدان التى من هذا القبيل، مازالت تختن الإناث.