حرر عدد من دفاع متهمي قضية خلية الظواهري، مذكرة إلي رئيس مجلس القضاء الأعلى، ضد المستشار محمد شرين فهمي، بعد إحالته أحد المحامين لمجلس التأديب، بعد مشادة درات بينهم أثناء سؤاله لأحد الشهود بالقضية. ووقع على المذكرة عدد كبير من أعضاء هيئة الدفاع للشهادة، إذا ما تم استدعاء المحامي المحال إلى المجلس التأديب. وكان سجال قد دار بين القاضي والمحامي علي إسماعيل، بعد قيامه بتوجيه أسئلة للشاهد عن شهادته التي أدلى بها حول القضية، ورفضت المحكمة توجيه عدد من الاسئلة للشاهد. وأكد الدفاع، أن هيئة المحكمة تحاول إملاء الشاهد، فقاطعه القاضي، وقرر اعتبر أن ما فعل يعد إهانة للمحكمة، وقررت إحالته لمجلس التأديب، كما قرر رفع الجلسة. وكشفت تحقيقات النيابة أن المتهمين من العناصر الإرهابية شديدة الخطورة قاموا بإنشاء وإدارة تنظيم إرهابي يهدف إلى تكفير سلطات الدولة ومواجهتها بالسلاح، لتغيير نظام الحكم بالقوة، والاعتداء على أفراد وضباط القوات المسلحة والشرطة واستهداف الأقباط ودور عبادتهم واستحلال أموالهم وارتكاب أعمال إرهابية بهدف نشر الفوضى في البلاد.