اتهم الشيخ نبيل نعيم، القيادي السابق في تنظيم الجهاد، عناصر من الجماعة الإسلامية بأنهم وراء العملية الإرهابية بالكرنك بالتنسيق مع بيت المقدس وأجناد مصر، مشيرًا إلى أن الجماعة الاسلامية تعمل وراء نشر الارهاب بمصر . وأضاف نعيم، خلال حواره مع الاعلامى عمرو عبدالحميد مقدم برنامج "حوار القاهرة " المذاع على شاشة "سكاى نيوز عربية" أن تنظيمات سيناء لاتستطيع الخروج من خارج المناطق الصحراوية لتنفيذ عمليات إرهابية فى أى محافظة خارج سيناء . وأوضح القيادي السابق في تنظيم الجهاد، أن الاخوان يمولون انصار بيت المقدس عن طريق غزة، وهذه المجموعات تعمل بهدف انهاك الدولة اقتصاديًا عن طريق ضرب القوات المسلحة والشرطة.