صرح الدكتور السيد عبد الخالق، رئيس جامعة المنصورة، بأنه سيتم افتتاح برامج نوعية جديدة بالجامعة مع بداية العام الدراسي الجديد 2013/2014 إضافة إلى البرامج القائمة بالفعل. وتتصدر كلية الهندسة قائمة الكليات المطبقة للبرامج الجديدة، حيث توجد بها 4 برامج نوعية، برنامجان تتم الدراسة بهما لأول مرة مع بداية العام المقبل، وهما الميكاترونيكس والهندسة الطبية الحيوية برسوم دراسية 300 جنيه لكل ساعة معتمدة، بالإضافة إلى برنامجين آخرين بالكلية وهما هندسة الاتصالات والمعلومات بواقع 250 جنيها لكل ساعة معتمدة، والتشييد والبناء برسوم دراسية 350 جنيها لكل ساعة معتمدة، وبرنامج إعداد معلمي العلوم والرياضيات باللغة الانجليزية للتعليم الأساسي (الحلقة الأولى) والتعليم العام بكلية التربية برسوم دراسية 3000 جنيه سنويا. وتوجد برامج أخرى مطبقة بكليات جامعة المنصورة، منها برنامج مانشستر للتعليم الطبي بكلية الطب، وهو الوحيد على المستوى الدولي الذي تقوم جامعة خارج إنجلترا بتدريسه لجامعة مانشستر تحت الإشراف والتدريب الإنجليزي والتدريس والتقويم المصري وبرسوم دراسية 10000 جنيه لكل فصل دراسى، كذلك برنامج الصيدلة الإكلينيكية بكلية الصيدلة برسوم دراسية 250 جنيها لكل ساعة معتمدة. كما يوجد شعبة الدراسة باللغتين الإنجليزية والفرنسية بكلية الحقوق، وشعبة الدراسة باللغة الإنجليزية بكلية التجارة. جدير بالذكر أنه يتم قبول الطلاب بالبرامج النوعية الجديدة من المرشحين للكلية عن طريق مكتب التنسيق الرئيسي في نفس العام الدراسي بنظام التنسيق بالأعلى في المجموع إذا كان الطلب على الالتحاق في البرنامج أكثر من الأعداد التي حددتها الكلية. أما عن الالتحاق بشعبتي اللغة الإنجليزية والفرنسية بكلية الحقوق فيكون من بين الطلاب المرشحين انتظام من مكتب التنسيق بالأعلى في المجموع الكلى لدرجات الطالب بشرط حصول الطالب على 37 درجة على الأقل فى مادة اللغة وفى حالة التساوي في المجموع الكلى تتم المفاضلة بين الطلاب بالأعلى في درجة اللغة. بينما يكون القبول بشعبة اللغة الإنجليزية بكلية التجارة من الطلاب المرشحين انتظام بالأعلى في المجموع بعد إضافة درجة اللغة الإنجليزية ودرجة المستوى الرفيع إن وجد إلى المجموع الكلى للطالب، شريطة أن يكون الطالب حاصلاً على 80% على الأقل في درجة اللغة برسوم دراسية 3000 جنيه سنويا.
