في يناير 2006 عقدت الجمعية العمومية للشركة القابضة لمصر للطيران اجتماعها برئاسة الفريق طيار أحمد شفيق، وزير الطيران المدنى آنذاك، تم خلالها اعتماد ميزانية الشركة للعام المالى 2004/2005.. وكشف المهندس عاطف عبد الحميد، رئيس الشركة القابضة لمصر للطيران في ذلك الوقت، أن الشركة حققت لأول مرة في تاريخها أرباحًا بلغت 435مليون جنيه، بزيادة عن أرباح العام الذي سبقه بلغت نسبتها 42 ٪، حيث بلغت أرباح العام 2003/2004: 303 ملايين جنيه.. أيضًا في الجمعية العمومية تمت الموافقة على صرف أرباح للعاملين بالقابضة تعادل 12 شهرًا، وتطوير الشركة القابضة والشركات التابعة لها، وخطة تنمية أسطول الشركة بالتعاقد على شراء 12 طائرة جديدة ليصل عدد الطائرات المملوكة للشركة إلى 64 طائرة بحلول عام 2010.