يثير الشيخ وجدي غنيم الجدل أينما ذهب حيث شنت منظمات حقوقية تونسية هجوما حادا علي غنيم الموجود حاليا في تونس بعد تصريحاته المتشددة ضد ختان الإناث لدرجة أن حركة «كلنا تونس» طالبت السلطات هناك بمنع وجدي غنيم من مواصلة سلسلة محاضراته التي طالب فيها أيضا الرجال بإطلاق اللحي وذلك بدعوة من جمعيات إسلامية سلفية.. كان هذا رأي الشيخ غنيم في ختان الإناث فماذا كان رأيه في الشيخ محمد حسان ومحمد البرادعي وياسر برهامي وعادل إمام والمجلس العسكري؟. الشيخ وجدي غنيم أقسم أنه لو لم يكن حازم صلاح أبوإسماعيل أعلن ترشيح نفسه لانتخابات رئاسة الجمهورية لكان هو قد رشح نفسه لأنه يريد أن يري الأيدي المتوضئة لأن النظام السابق نهب البلد وأضاعها وحط من كرامة المصريين ويجب الحكم بشرع الله واستشهد بالآية الكريمة:«ولو أن أهل القري آمنوا واتقوا لفتحنا عليهم بركات من السماء والأرض» ويري غنيم أن مواقف عبدالمنعم أبوالفتوح غير منضبطة -حسب قوله- لأن الأخير قال إن إله المسلمين والمسيحيين واحد وقال لأبوالفتوح «روح دق صليب» يا أخ عبدالمنعم ويعني إيه الدولة المدنية ولو حكمني مسيحي أوامرأة والكلام ده مينفعش وأنا بحب إخواني في الله لكن أحب الحق أكثر منهم ولكن لما بشوفهم منبطحين أقول ده مينفعش جماعة الإخوان ثبتوا في السجون وبدأوا يستخدمون ألفاظا مثل الدولة المدنية فقول الدولة الإسلامية الكفرة «مبيتكسفوش» وعينهم أد كده وربنا ملوش في الحياة بتاعتنا هما بيتكلموا بصراحة وناس واضحين ولذلك يجب أن يكون المسلمون واضحين هما كمان فالإسلام هو الاستسلام والخضوع والانقياد والإذعان والتسليم المطلق لأوامر الله واللي مش عاجبه كلام ربنا يطلع بره الدين ومصر عدد سكانها 80 مليون والصليبيون فيها - حسب قوله - 5 ملايين هم أقلية والأقلية في الدولة المسلمة متعملش راسك براسي وميطلعش واحد يقول المواطنة والحقوق المتساوية يعني ازاي تساوي بين 80 مليون و5 ملايين وعمرنا ما شفنا مسيحي بيصلي قدام كنيسة من الزحمة أقسم بالله هما واخدين حقوقهم واحترم وأقدر المسيحي اللي يحب مصر مش يستقوي علينا بأمريكا». ووجه حديثه إلي الفنان عادل إمام «قائلا سوف نقف بين يدي الله ونختصمك عنده وبدل ميعمل أفلام يقل أدبه علي الإسلام ويشتمنا فيها ويقل أدبه علي اللحية وحجاب المرأة ونقاب المرأة المسلمة ويسوء سمعتنا فإني أقول له حسبنا الله ونعم الوكيل فيك ولايجوز التبرير للنفس فهناك راقصة تقول الإسلام دين العمل والعمل عبادة والرقص عمل إذن الرقص عبادة والرقصة اشتغلت ممثلة فتقول الحمد لله من علي فأصبحت ممثلة وراقصة من فضل الله عز وجل وأخري تقول هطلع عمرة عشان ربنا وفقني في الفيلم اللي فات ولو شفت الفيلم تري عوراتها كلها مكشوفة والعياذ بالله وبينهما رقص و«دنس» وللشيخ وجدي غنيم رأي في ترشيح الدكتور البرادعي فيقول في تسجيل صوتي علي موقعه: «البرادعي كان في منصب يمنع بموجبه تكنولوجيا الذرة عن الدول الإسلامية إلا الكيان الصهيوني كان يجرؤ يجيب سيرتهم كان يجرؤ يفتش زي البلاد العربية، الصهاينة عندهم أكثر من 180 رأس لكن هو راجل علي المسلمين فقط وأمريكا تدعمه وهو يقول مستعد أن نتناقش حول المادة الثانية من الدستور التي تقول الدين الإسلامي هو الدين الرسمي للدولة اللي يمس هذه المادة يبقي «كافر» أنت عايز تلغي الإسلام». وعلي المرصد الإسلامي بث الشيخ وجدي غنيم تسجيلا صوتيا بعنوان «فاض الكيل يا شيخ محمد حسان» قال فيه «الحقيقة كنت واخد علي نفسي عهد ألا أتكلم عن أي حد من الاتجاه الإسلامي لأنه قد يفسر غلط وكنت ساكت علي كثير من الأخطاء فالشيخ محمد حسان مش واخد باله في يوم عرفات ومن علي عرفات وعمال تؤيد المجلس العسكري بدل ما تكلمهم عن الحج وكفاية اللي حصل منك قبل كده والفضايح وأرجو أنه يطلع ويغلط نفسه بدل ما هيفقد ثقة الناس وقبل كده قال إن المظاهرات بتكسر العربيات والمصانع وبعدين في أحداث الثورة بتقول ارجعوا للبيوت ومن فضل الله علي الثورة أن القنوات الإسلامية كانت مقفولة وإلا كان النظام السابق انتقم وهناك فرق بين المجلس العسكري والجيش يا شيخ محمد ومصر مش زي ليبيا أنا كنت ضابط احتياطي ولو كان طلب مني أضرب أهلي وناسي والله ما كنت فعلت يا شيخ محمد حسان المجلس العسكري هو اللي كان مؤيد لحسني مبارك طوال حياته وكانوا رجالته وهو المجلس اللي شكر حسني مبارك لأنه قالهم انتوا اللي هتمسكوا البلد من بعدي والمجلس طلع كداب وقال هسلم السلطة ومحصلش وهو اللي بيصدر الغاز لإسرائيل ويعين وزراء من الحزب الوطني الديمقراطي بتاعهم».
