لايزال تطوير مدينة «القناطر الخيرية»، التى شيدها محمد على باشا، يواجه الكثير من التحديات وعلى رأسها تعدد جهات الولاية على الأراضى بالمدينة، وذلك حسب تصريحات المحافظ اللواء الدكتور رضا فرحات، محافظ القليوبية، الذى أشار إلى أن الولاية متعددة بين وزارات الرى والزراعة والآثار. وأضاف أنه لا يستطيع إنجاز أى تطوير داخل المدينة إلا بعد حل تلك المشكلة، لافتا إلى أنه سيتم توقيع بروتوكول تعاون مع تلك الوزارات خلال الفترة المقبلة وطرح فكرة المشروع على المستثمرين.