أصدر مجمع البحوث الاسلامية قانون رقم 103، والذي يقضي بتحديد سن التقاعد لشيخ الأزهر عند 80 سنة في سابقة تعد الأولى من نوعها على مدى تاريخ الجامع الأزهر. وينص القانون أيضًا على انتخاب شيخ الأزهر، بدلاً من تعيينه من قبل رئيس الجمهورية كما كان في السابق، ويشترط ان يكون من بين أعضاء هيئة كبار العلماء وأن يكون أستاذ بالأزهر، وله مؤلفات كثيرة وأكثر أعضاء الهيئه علمًا. وأوضح الدكتور محمود عزب مستشار الحوار بالأزهر فى مداخله تليفونيه ببرنامج 90 دقيقة الذي تبثه فضائية "المحور"، أن د. أحمد الطيب اقترح أن يكون سن التقاعد لشيخ الأزهر 70 عامًا بدلا من 80، ولكن مجمع البحوث أتفق أن يكون حتى سن الثمانين. وأشار عزب الى أن "الطيب" أراد التنازل عن منصبه كشيخ للأزهر عقب الثورة، وأن يتم اختيار شيخًا جديدًا بالانتخاب، ولكن المجمع رفض ذلك في ضوء عدم استقرار الأوضاع التي يجب أن يتماسك فيها الأزهر – حسب تصريحاته. ومن الجديد بالذكر أن كان النظام المتبع أن ينتخب من بين كبار العلماء ناظر يشرف على شئونه منذ إنشائه إلى آخر القرن الحادي عشر الهجري. فقد أنشئ منصب شيخ الجامع الأزهر في عهد الحكم العثماني ليتولى رئاسة علمائه، ويشرف على شئونه الإدارية، ويحافظ على الأمن والنظام ، فقد تولى منصب شيخ الأزهر منذ إنشائه 48 شيخاً ، أخرهم فضيلة الدكتور أحمد الطيب 1.الشيخ محمد عبد الله الخرشي المالكي المتوفى سنة 1101ه / 1690م 2.الشيخ إبراهيم بن محمد بن شهاب الدين البرماوي الشافعي 1101 ه - 1106 ه/ 1690م - 1694م 3.الشيخ محمد النشرتي المالكي 1106 ه - 1120 ه / 1694 م - 1708م 4.الشيخ عبد الباقي القليني المالكي 1120 ه- ؟ / 1708م 5.الشيخ محمد شنن المالكي 1133 ه / 1721 م 6.الشيخ إبراهيم موسى الفيومي المالكي 1133ه - 1137 ه / 1721م - 1725م 7.الشيخ عبد الله الشبراوي الشافعي 1137 ه - 1171 ه / 1725م - 1757م 8.الشيخ محمد سالم الحفني الشافعي 1171 ه - 1181 ه / 1757م - 1767م 9.الشيخ عبد الرؤوف السجيني الشافعي 1181 ه - 1182 ه / 1767م - 1768م 10.الشيخ أحمد الدمنهوري الشافعي 1182 ه -1190 ه / 1767م - 1776م (عطلت المشيخة مدةً بسبب نزاعات وشغب بين الحنفية والشافعية 11.الشيخ أحمد بن موسى بن داود أبو الصلاح العروسى من أسرة العروسي الشافعي 1192 ه - 1208 ه / 1778 م - 1793م 12.الشيخ عبد الله الشرقاوي الشافعي 1208ه - 1227 ه / 1793م - 1812م 13.الشيخ محمد الشنواني الشافعي 1227 ه - 1233 ه / 1812م - 1818م 14.الشيخ محمد بن أحمد العروسي أسرة العروسي الشافعي 1233 ه - 1245 ه / 1818م - 1829م 15.الشيخ أحمد بن علي الدمهوجي الشافعي 1245 ه - 1246 ه / 1829م - 1830م 16.الشيخ حسن بن محمد العطار 1246 ه - 1250 ه / 1830م - 1834م 17.الشيخ حسن القويسني الشافعي 1250 ه - 1254 ه / 1834م - 1838م 18.الشيخ أحمد عبد الجواد الشافعي 1254 ه -1263 ه / 1838م - 1847م 19.الشيخ إبراهيم الباجوري الشافعي 1263 ه - 1277 ه / 1847 - 1860م حدثت اضطرابات في الأزهر، فظل بلا شيخ، وتم تعيين أربعة وكلاء نيابة عن الشيخ الباجوري للقيام بشئون الجامع، ولما توفي سنة 1277 ه (1860م) استمروا في القيام بشئون الأزهر حتى عين الشيخ العروسي 20.الشيخ مصطفى العروسي أسرة العروسي 1281 ه - 1287 ه / 1864م - 1870م 21.الشيخ محمد المهدي العباسي الحنفي 1287 ه - 1299 ه / 1870م - 1882م 22.الشيخ شمس الدين الإنبابي الشافعي 1299 ه - 1313 ه / 1882م - 1896م 23.الشيخ حسونة النواوي الحنفي 1313 ه - 1317 ه / 1896م - 1900م 24.الشيخ عبد الرحمن القطب الحنفي النواوي 1317 ه /1900م 25.الشيخ سليم البشري المالكي 1317 ه - 1320 ه / 1900م - 1904م 26.السيد علي بن محمد الببلاوي، استقال في شهر محرم عام 1323 ه / 1905م 27.الشيخ عبد الرحمان الشربيني، استقال سنة 1327 ه / 1909م 28.الشيخ حسونة بن عبد الله النواوي، استقال في العام نفسه 1327 ه - 1909م 29.الشيخ سليم البشري إلى سنة 1335 ه/ 1916م 30.الشيخ محمد أبو الفضل الجيزاوي (14 ذي الحجة 1325 ه - 1348 ه / 1907م-1928م 31.الشيخ محمد مصطفى المراغي الحنفي: من 1928م إلى أن استقال سنة 1930م 32.الشيخ محمد الأحمدي الظواهري (1930م - 1935م 33.الشيخ محمد مصطفى المراغي "للمرة الثانية" 1935م - 1945م 34.الشيخ مصطفى عبد الرازق 1945م - 1947م 35.الشيخ محمد مأمون الشناوي 1948م - 1950م 36.الشيخ عبد المجيد سليم البشري 1950م - 1951م 37.الشيخ إبراهيم حمروش (1951م - 1952م 38.الشيخ عبد المجيد سليم البشري "للمرة الثانية" 1952م - 1952م 39.الشيخ محمد الخضر حسين 1952م - 1954م 40.الشيخ عبد الرحمن تاج 1954م - 1958م 41.الشيخ محمود شلتوت 1958م - 1963م 42.الشيخ حسن مأمون 1963م - 1969م 43.الدكتور محمد الفحام 1969م - 1973م 44.الدكتور عبد الحليم محمود 1973م - 1978م 45.الدكتور محمد عبد الرحمن بيصار 1979م - 1982م 46.الشيخ جاد الحق علي جاد الحق 1982م - 1996 م 47.الدكتور محمد سيد طنطاوي 1996 م- 10 مارس 2010م - 24 ربيع الأول 1431 ه 48. الدكتور الشيخ أحمد الطيب من 2010 حتى الآن