بمناسبة بلوغه سن الخامسة والسبعين تقدم البطريرك أنطونيوس نجيب بطريرك الأقباط الكاثوليك باستقالته لسنودس الكنيسة القبطية الكاثوليكية عملاً بالقانون الكنسي ولكن آباء السنودس رفضوا هذه الاستقالة مطالبين غبطته بالاستمرار في مهامه البطريركية وقيادة الكنيسة وقد خضع البطريرك لرغبتهم قائلاً: أنا خادم الرب ليكن لي كقولكم. الجدير بالذكر أن الأنبا أنطونيوس كان قد انتخب بالإجماع في 30 مارس 2006 ليشغل منصب البطريرك وذلك بعد أن تقدم البطريرك السابق أسطفانوس الثاني باستقالته لظروف صحية.