شهدت كليات الجامعة العديد من الوقفات الاحتجاجية في أخر أيام الدراسة قبل أجازة عيد الأضحي، حيث نظم العشرات من طلاب جماعة الإخوان المحظورة بكلية الزراعة بجامعة القاهرة، مسيرة طافت أرجاء الكلية، للمطالبة بالإفراج عن المقبوض عليهم من الطلاب، وللتنديد بقمع الأمن لطلاب الجماعة. ووقعت بعض المشادات الكلامية بين طلاب الإخوان المتظاهرين والطلاب المؤيدين للجيش في الكلية، والذين رفعوا صور الفريق عبد الفتاح السيسى، ردا على الهتافات التي يطلقها طلاب الإخوان ضد الجيش والشرطة، ورفع طلاب الإخوان شارات رابعة العدوية واصفين إياها برمز الصمود. ونظم العشرات من الطلاب المؤيدين للجيش، والفريق أول عبد الفتاح السيسي، بجامعة القاهرة وقفة لدعم الجيش في مواجهة ما وصفوه بإرهاب جماعة الإخوان المحظورة. وفي نفس السياق، نظم العشرات من طلاب كلية صيدلة جامعة القاهرة، وقفة احتجاجية أمام مبنى الكلية، للمطالبة بالقصاص لزملائهم المتوفين في الأحداث الأخيرة، والمطالبة بالإفراج عن زملائهم المقبوض عليهم وردد المتظاهرون هتافات للمطالبة بتحقيق مطالبهم. ونظم المئات من طلاب كلية الهندسة جامعة القاهرة، سلسلة بشرية أمام الباب الرئيسي للكلية، للمطالبة بالإفراج عن زملائهم المعتقلين، وتنديداً بوفاة أحد زملائهم في الأحداث الأخيرة. ووقف الطلاب على جانبي الشارع أمام مبنى الكلية، رافعين صورا للطلاب المعتقلين ومرددين هتافات مناهضة لقوات الأمن المركزي والشرطة التي ألقت القبض على زملائهم، ومن جانبها فتحت قوات الجيش المتواجدة في ميدان النهضة، الميدان أمام المارة والسيارات، بعد غلقه لمدة 3 ساعات بسبب مظاهرات طلاب الإخوان بجامعة القاهرة. وعلى الجاني الأخر، قال الدكتور عز الدين أبو ستيت، نائب رئيس جامعة القاهرة لشئون التعليم والطلاب، إن اليوم الخميس هو آخر أيام الدراسة بالجامعة قبل إجازة عيد الأضحى المبارك، موضحاً أن إدارة الجامعة قررت إعطاء يوم الأحد القادم الموافق 13 من أكتوبر، لتكون إجازة عيد الأضحى بالجامعة أسبوعاً كاملاً، مشيراً إلى أن عودة الدراسة للجامعة السبت 19 من أكتوبر الجاري.