طالب قائد الطائرة المصرية المتجهة إلى أبوجا العودة إلى المطار بعد إقلاعه بساعتين بسبب وجود عطل في أجهزتها الملاحية، الأمر الذي يحول دون إتمام الرحلة. وقد تلقى برج المراقبة بمطار القاهرة اتصالا من قائد رحلة مصر للطيران رقم (887) المتجهة إلى أبوجا يفيد بوجود عطل في الأجهزة الملاحية للطائرة و يطلب السماح له بالعودة..
وبعد هبوط الطائرة تم نقل الركاب البالغ عددهم 55 راكبا إلى طائرة أخرى استأنفت رحلتها بعد تأخير استمر 3 ساعات بينما تولى فريق فني إصلاح الطائرة الأولى.