وقعت وزارة الدولة لشئون البيئة برتوكولا للتعاون مع المعهد القومي لعلوم البحار والمصايد للبدء في تنفيذ برنامج رصد نوعية المياه والرواسب لبحيرات التمساح والبحيرات المرة "الصغرى والكبرى ، ويهدف هذا البرنامج إلى عمل مسح شامل للوضع البيئي الحالى بكل من هذه البحيرات ومصادر التلوث التى تتعرض لها وكمياتها وعلاقة ذلك بمستويات الصرف السائدة والأنشطة البشرية القائمة ومصادر المياه المغذية للبحيرات. كما يهدف هذا البرنامج إلى جمع عينات مائية ورواسب بصفة موسمية "أربع مرات سنوياً " من مواقع ثابتة أي 10 مواقع لبحيرة التمساح و 12 موقع للبحيرات المرة الصغرى والكبرى ، مع وضع خريطة حديثة لكل بحيرة موضح عليه مواقع الرصد. بالإضافة إلى تجميع الدراسات السابقة التى تمت على بحيرة التمساح والبحيرات المرة الصغرى والكبرى . ويعد هذا البرنامج إستكمالا للبرنامج القومي الدوري لرصد نوعية المياه والرواسب والهائمات النباتية والحيوانية لجميع البحيرات بجمهورية مصر العربية والذي تم البدء فيه برصد البحيرات الشمالية . الجدير بالذكر أن هذا البرنامج يعتبر بداية لإستراتيجية متكاملة لإدارة البحيرات الشمالية المصرية(البردويل، المنزلة، البرلس، إدكو، مريوط)، حيث تهدف هذه الإستراتيجية إلى تحقيق تنمية مستدامة للبحيرات والحفاظ عليها من التلوث من خلال برنامج يختص بالمتابعة الدورية للوضع البيئي لنوعية المياه والرواسب القاعية والهائمات النباتية والحيوانية والأسماك . مما يزيد من الثروات الطبيعية من الأسماك. وقد تم البدء في تنفيذ هذا البرنامج في أغسطس 2009 بالتعاون مع المعهد القومي لعلوم البحار والمصايد وتم بالفعل الإنتهاء من الرحلة الحقلية الأولى، والتي إستهدفت رصد عدة قياسات للعينات المائية والرواسب القاعية بإستخدام الطرق القياسية طبقاً لنظام الكفاءة والجودة( أيزو 17025)
