تشارك وزارة الدولة لشئون البيئة حالياً في أعمال المسح والرصد البيئي لثلاثة موانئ بمنطقة جونة السويس بالبحر الأحمر، وذلك لدراسة الكائنات الدقيقة والغازية بالموانئ الثلاث حتى يمكن الحد من دخول أي كائنات غريبة على بيئة البحر الأحمر قادمة مع مياه الصابورة بالسفن العابرة له. وكانت الوزارة سابقاً قد شاركت في إعداد الإستراتيجية الوطنية لإدارة مياه الصابورة "مياه اتزان السفن والرواسب على السفن المبحرة في المياه الإقليمية المصرية بالبحر الأحمر " وذلك من خلال مجموعة الأعمال الوطنية المكلفة بها وتشمل جميع الوزارات والقطاعات ذات الصلة ومنها وزارة الدولة لشئون البيئة والهيئة العامة لموانئ البحر الأحمر ومعهد علوم البحار والمصايد والقوات البحرية وهيئة الثروة السمكية والتفتيش البحري. وتختص لجنة العمل الوطنية بعدة مهام منها تطوير خطة العمل الوطنية لإعداد وتطبيق إستراتيجية وطنية لإدارة مياه الصابورة في الموانئ بالإضافة إلى التزود بالمعلومات المطلوبة لإدارة مياه الصابورة والتنسيق بين الأجهزة الحكومية والقطاعات الصناعية المختلفة التي تؤثر على نوعية مياه البحر بالإضافة إلى تقديم الدعم المادي والفني لإعداد هذه الإستراتيجية . كما تسعى لجنة العمل الوطنية إلى دعم التعاون الإقليمي على مستوى الدول المطلة على البحر الأحمر وإيجاد فرص للتعاون بين تلك الدول ووضع أطر عامة وإطار تنظيمي للإستراتيجيات الوطنية في كل دولة وتوحيد التطبيقات المختلفة لاتفاقية المنظمة البحرية الدولية.
