فرضت أجهزة الأمن والجيش إجراءات أمنية مشددة على المجرى الملاحى لقناة السويس. وأوضح مصدر أمنى أن حالة من الاستنفار الكبيرة شملت كل قطاعت الأمن، بدأت فور إعلان نبأ حادث رفح وأنه تم زيادة عدد الدوريات الأمنية على جميع الطرق المؤدية للمجرى الملاحى، بجانب تشديد الإجراءات الخاصة بالعبور على جميع المعديات والكبارى على قناة السويس، والقبض على أى مشتبه به على الفور.
وأوضح المصدر أن تعليمات صدرت من قيادات عليا بالاستعداد لأوامر جديدة يعتقد أنها عمل عسكرى كبير أو أمنى داخل سيناء خلال ال24 ساعة القادمة للرد على العملية، ومحاولة القبض على الجناة.