قال الدكتور محيي الدين عفيفي الأمين العام لمجمع البحوث الإسلامية إن محمد عبد السلام مستشار شيخ الأزهر لا يتدخل في اختيار مبعوثي الأزهر للخارج ومشاركته في لجان الاختيار. وكانت مصادر أزهرية أكدت أن «عبدالسلام» يتدخل في إدارة مجمع البحوث الاسلامية وأنه يقوم بإختيار مبعوثي الازهر بحسب الولاء له. وأضاف الأمين العام في بيان له اليوم أنه فيما يتعلق بمسألة اختيار مبعوثي الأزهر فإن لجان اختيارهم تُشكل من أعضاء هيئة التدريس في جامعة الأزهر في التخصصات المختلفة حسب التخصصات المطلوبة للابتعاث وهو ما يعلن عنه رسميا في كل مسابقة ويتم نشر متابعات مستمرة للجان بالصور في كل الصحف. أوضح عفيفي أن الإمام الأكبر حرص على أن تشتمل اللجان المشكلة لاختيار المبعوثين على عدد من السفراء من وزارة الخارجية لأهمية جانب البروتوكول في عمل المبعوث خاصة في المناسبات واللقاءات المختلفة التي يشارك فيها المبعوثون، ومن ثم فإن مستشار الإمام الأكبر - المستشار محمد عبد السلام – لم يشارك في أي مرحلة من مراحل اختيار المبعوثين.