قرر الشيخ محمد حسان إلغاء البرامج السياسية من قناة الرحمة بعد نشوب أزمة بين القناة والداعية السلفي محمد حسين يعقوب بعد قراءة أحد المذيعين بالقناة خبرا نشر في بعض المواقع الإليكترونية عن تواجد يعقوب مع الشيخ محمد الظواهري شقيق أيمن الظواهري بمقر اعتصام وزارة الدفاع للشد من أزر المعتصمين، وتأكيدا لهم من قبل يعقوب أنهم جاءوا من أجل تطبيق الشريعة واعتذارا منه على ما نسب إليه بدعوته للعلماء بالمحافظة على مصر وشعبها من فتنة أنصار أبو إسماعيل، وهو ما كذبه الشيخ محمد حسين يعقوب واتهم مذيع قناة الرحمة الذي قرأ الخبر بالكذب . أرسل الشيخ محمد حسان الداعية الاسلامى رسالة للشيخ محمد حسين يعقوب تطييب خاطر وإعتذار بلسان قناة الرحمة بعد الموقف الذي أغضب الشيخ على الهواء من جراء نشر خبر مكذوب عنه دون تثبت. حيث أكدت الصفحة الرسمية للشيخ يعقوب ان الشيخ محمد حسان أكد على إتخذ قرارات صارمة لضبط منهج القناة. وقالت الصفحة ان الرسالة التى ارسلها حسان تتضمن ما يلى "أقبل رأس أخي الحبيب أبي العلاء الشيخ محمد حسين يعقوب وأعتذر له، فأنت يا شيخ على الحق ، ويجب لمن ينقل الأخبار أن يتحقق أولا؛ فمنهجنا واحد،وإلا فبالطريقة هذه يبقى الإعلام مضلل، نتهم الشيخ ثم نتصل بيه،لأ كان لازم نتحقق الأول!" وتابع حسان فى رسالته "ليس هذا نا تربينا عليه ،وألزمت أخي محمود أن قناة الرحمة ترجع أصلها قناة دعوية وملناش دعوة بالسياسة؛ أنا فاتحها عشان تعلموا الناس الدين والعقيده والسنة ويتم إلغاء أي برنامج سياسي أو يتكلم فيه علي قناة الرحمة" من جانبه أكد حسن حسان مدير مكتب الشيخ محمد حسان صحة ما نشرته صفحة الشيخ محمد حسين يعقوب على الفيس بوك موضحا أن الشيخ حسان اعتذر عما بدر من القناة من إدعاء على الشيخ وأنه قرر عودة "الرحمة" لهدفها الرئيسي وهو نشر الدعوة وليس السياسة وتعقيبا على الكلام ذاته قال الدكتور هشام كمال عضو الجبهة الاعلامية بالجبهة السلفية-عبر حسابه على تويتر- أن القائم بإلغاء البرامج السياسية من القنوات الفضائية الاسلامية بحجة انها قنوات دعوية فقط انما يكرس العلمانية بفصل الدين عن السياسة
