قام دفاع متهمى مذبحة رفح الثانية بالدفع بعدم الاختصاص المكانى لإنعقاد المحكمة وبطلان التحريات التى بنيت عليها القضية لعدم إختصاص مجرى التحريات مكانيا، بطلان تحقيقات أمن الدولة مع المتهمين لعدم حضور محامى، وكما دفع ببطلان الاحراز والتسجيلات للعبث بها وعرضها على بعض القنوات. جاء ذلك أمام محكمة جنايات القاهرة، المنعقدة بمعهد أمناء الشرطة بطره، برئاسة المستشار محمد شيرين فهمى.
كما دفع ببطلان تفريغ الخبير الفنى لعدم أداء القسم وعدم وجود محاضر أعمال من بدء المأمورية وحتى نهايتها، وذلك بجلسة محاكمة المتهمين "عادل حبارة" و34 متهمًا آخرين بخلية "المهاجرين والأنصار"، فى القضية المعروفة إعلاميًا ب"مذبحة رفح الثانية".