نفت وزارة الأوقاف اتهامها لدولة الامارات العربية الشقيقة بأنها تنشر كتبا تحمل الفكر الشيعي داخل المساجد. وأكدت الوزارة في بيان لها منذ قليل عن كامل التعاون والتنسيق مع وزارة الأوقاف الإماراتية لافته الى أن دولة الإمارات العربية المتحدة دولة سنية وسطية شقيقة تنسق تنسيقًا كاملا مع الأزهر الشريف ومع وزارة الأوقاف المصرية، ونكن لها ولأهلها ولمنهجها الوسطي كل تقدير واحترام، وأن ما ذكر باحد المواقع الإخبارية في هذا الشأن عار تمامًا من الصحة. واوضحت الوزارة ان خطيب هذا المسجد كان خطيبًا بالمكافأة وقد تم استبعاده وإلغاء ترخيصه ولن يسمح له باعتلاء المنابر، ورأيه لا يمثل الأوقاف بأي شكل من الأشكال.