طالبت هيئة الدفاع عن المتهمين في قضية التخابر، بضم مذكرة النيابة يوم 29 سبتمبر 2011 المرسلة للقاضي المنتدب للتحقيق في بلاغ النائب العام بشأن قضية وادي النطرون، كما طلب ضم إذن النيابة الصادر في 2011 والمشار إليه في أوراق القضية الخاصة بالتسجيل ومحضر التحريات الخاص بالقضية المنظورة. كما طالب الدفاع بتكليف وزارة الخارجية بتقديم محاضر الاجتماعات التي قام بها عصام الحداد بصفته مستشارًا للرئيس للشئون الخارجية، وطالب تكليف مصلحة السجون، بإرفاق بيانات سجن العقرب شديد الحراسة بطرة عن تاريخ وجود المتهم وتاريخ حبسه وكيفية ضبطه ومستندات تسليمه للسجن، وطالب التصريح باستخراج شهادة من الجدول في القضية رقم 404 حصر أمن دولة عليا وضم الحكم الصادر في اللجنة رقم 6302 لسنة 2012 جنح الإسماعيلية "الهروب من سجن وادي النطرن" والحكم الصادر لاستئنافها وصورة رسمية من محاضر الجلسات. وتضم القضية 20 متهمًا محبوسًا بصفة احتياطية على ذمة القضية، يتقدمهم محمد مرسي وكبار قيادات تنظيم الإخوان، على رأسهم المرشد العام للتنظيم محمد بديع وعدد من نوابه وأعضاء مكتب إرشاد التنظيم وكبار مستشاري الرئيس المعزول، علاوة على 16 متهمًا آخرين هاربين أمرت النيابة بسرعة إلقاء القبض عليهم وتقديمهم للمحاكمة محبوسين احتياطيًا.