تلعب المدارس المسيحية في مصر دورا كبيرا في العملية التعليمية التربوية ليس فقط للطلبة المسيحيين بل وللطلبة المسلمين الذين في كثير من الاحيان يمثلون الأغلبية في هذه المدارس بنسبة تتراوح بين الثلث إلي الثلثين لصالح المسلمين. هذه المدارس في مصر تعود إلي القرن الثامن عشر أنشأت أول مدرسة في عام 1847 وهي مدرسة القديس يوسف في الخرنفش بحي الظاهر ثم مدرسة فريد باب اللوق في عام 1888 ودي لاسال بالظاهر ايضا في 1898 فمدرسة القديس بولس في عام 1890 ثم مدرسة سان جيريال في سبورتنج بالاسكندرية في عام 1900. ثم كلية سان مايكل في الاسكندرية ايضا عام .1928 معظم المدارس المسيحية أو مدارس الراهبات والرهبان كما يطلق عليهما تنتمي إلي الطائفة الكاثوليكية مما جعل الفاتيكان ينشئ هيئة أخوة المدارس المسيحية بالفاتيكان في روما. وفي مصر يوجد أمانة عامة يتولي منصب الأمين العام بها الأب فاضل سيداروس. يبلغ عدد المدارس الكاثوليكية في مصر 168 مدرسة بجانب عدد يقترب من ال50 مدرسة تابعة للطائفة الإنجلية أو البروتستانت.. وأشهرها رمسيس كولدج بشارع رمسيس والمدرسة الألمانية بالدقي ثم يأتي عدد أقل كثيرا تابع للطائفة الأرثوذكسية. يقول مسيو مجدي قزمان مدير مدرسة فريد باب اللوق أن هذه المدارس لا تتطرق في مناهجها إلي النواحي الدينية بأي شكل ولا يوجد أي نوع من التفرقة بين التلاميذ وفقا للديانة. فهذه المدراس أقامها الرهبان والأباء من أجل بناء الإنسان والتعامل علي هذا الأساس جعل هذه المدارس تهتم بالتربية أولا ثم التعليم. ولا يتم أي تفرقة بين الطلاب في فصول المدرسة إلا في حصة الدين حيث يتلقي الطلاب المسيحيون دروسهم في الكنيسة والطلاب المسلمون في الفصل الدراسي. كما يوجد في كل مدرسة مكان بمثابة مسجد مخصص لأداء الطلاب المسلمين الصلوات. أوضح أن القبول بالمدارس المسيحية ايضا لا يتوقف علي الديانة حيث يكون السن هو معيار القبول مع اجراء مقابلة للطالب والأسرة للتأكد من المستوي الثقافي للأسرة. وأكبر دليل علي عدم التفرقة بين الطلاب علي أساس ديني نسبة الأعداد في هذه المدارس فمثلا فريد باب اللوق يوجد بين طلابها 6.64% مسلمون و4.36% فقط مسيحيون.. في مدرسة سان مايكل 70% من الطلاب من المسلمين و30% من المسيحيين. وهناك استثناء بسيط لهذه القاعدة في بعض الأماكن التي توجد بها أغلبية من الأخوة الاقباط مثل شبرا حيث يزيد عدد الطلبة المسيحيين بسبب طبيعة التركيبة السكانية. من أشهر الأماكن التي توجد بها مدارس مسيحية باب اللوق ورمسيس والظاهر ومصر الجديدة وشبرا. أما من أشهر المدراس المسيحية في مصر بالنسبة للمدارس الفرنسية للبنات نوتردام في مصر الجديدة وشبرا والفرنسيسكان والسكركير في باب اللوق والميردي دييه في قصر العيني والديلي فراند في رمسيس والعائلة المقدسة في حلوان.. أما أشهر المدراس الفرنسية للأولاد العائلة المقدسة "جيزويت" برمسيس ومصر الجديدة ودي لاسال بالظاهر والعزيز بباب اللوق. ومن أشهر المدارس الأنجليزية للبنات مدرسة سانت كلير في الكوربة بمصر الجديدة وسان جوزيف "القديس يوسف" بالكوربة ومدارس الأولاد سان جورج بمدينة نصر والمدرسة البطركية بشارع رمسيس.
