قالت وزارة الأوقاف، إنها لم تأمر بحرق كتب بمكتبات المساجد، لبعض المشايخ والعلماء المحسوبين على جماعة الإخوان، واكدت الوزارة في بيان أصدرته، أنها لم تأمر بحرق أي كتب على الإطلاق ، وإنما وجهت بفحص جميع الكتب بمكتبات المساجد ، وجمع الكتب التي تحمل أفكارًا تدفع إلى التشدد ، وإيداعها بمخازن المديريات ، تمهيدًا لتشكيل لجنة عليا لإعادة الفحص ، وذلك تجنيبًا لخطر الفكر المتشدد، حسب البيان. وأشارت "الأوقاف"، أن ما نشر في بعض الصحف عن حرق الكتب عارٍ تماما عن الصحة وعن منهج الوزارة ، وأرفقت الأوقاف في بيانها صورة الإشارة التليفونية والتلغرافية المبلغة لجميع المديريات ، مشددة أنه لم يصدر عن الأوقاف سوى هذه الإشارة . يذكر أن وزير الأوقاف عقب جولة قام بها منذ ثلاثة أيام، أصدر تعليمات لجميع مسؤولى المكتبات بالأوقاف بإعادة فحص مكتبات الأوقاف وإخلائها من الكتب التى تمثل مناهج فكرية مخالفة لوسطية الأزهر، وكانت إحدى الصحف الخاصة قد نشرت في صفحتها الأولى صباح اليوم خبرًا يُفيد بأن وزارة الأوقاف أمرت بحرق كتب الإخوان المتواجدة بمكتبات المساجد، وهو ما نفته الوزارة في البيان الرسمي الذي أصدرته.