قرر الاتحاد المصري لكرة القدم، الاستجابة لمطالب بعض الأندية المحتجة على إدراجها ضمن مجموعات بالقسم الثاني بعيدة جغرافيا، فقد تم نقل فريق طوخ من المجموعة الخامسة إلى المجموعة الثالثة على أن يتم وضع فريق سرس الليان بدلًا منه وتم نقل فريق «الزرقا» من المجموعة الرابعة للخامسة بدلًا من فريق «أجا» وذلك للاحتقان الشديد بين جمهور«الزرقا» ومنتخب السويس للأحداث المؤسفة التى شهدتها مباراتهم معا والتى شهدها «الممتاز ب» الموسم الماضي خوفًا من تكرارها.وفى شأن آخر أجريت الخميس، قرعة دوري القسم الثانى لموسم« 2013-2014» بمشروع «الهدف» بحضور أحمد مجاهد وإيهاب لهيطة عضوي مجلس إدارة الاتحاد ومندوبي 33 ناديًا من المشاركين في المسابقة وأسفرت قرعة الأسبوع الأول عن المجموعة الأولى:«أسوان مع المدينة المنورة، قنا مع سكر نجع حمادي، المراغة مع مكةالمكرمة،سوهاج مع شبان المراغة،الألمونيوم مع شبان قنا، التعدين مع غرب سهيل،الأقصر مع كيما أسوان».وفى المجموعة الثانية يلعب كل من: «ناصر الفكرية مع الوليدية والواسطة مع نادي محافظة الفيوم ،شباب سنورس مع الوادى الجديد وبترول أسيوط مع منية الحيط ،شباب سمالوط مع بني سويف،الأسيوطى مع ناصر ملوي ،منفلوط مع شباب مغاغة».وفى المجموعة الثالثة يلعب: «الشرقية للدخان مع النصر والإعلاميين مع شباب طوخ وبهتيم مع مياه القاهرة والاتصالات مع البلاستيك والسكة الحديدة مع نجوم المستقبل وسكر الحوامدية مع الترسانة والشمس مع حلوان».والمجموعة الرابعة: « السويس مع أبو صوير والشرقية مع نجمة سينا وغزل دمياط مع كهرباء الإسماعيلية و المريخ مع دمياط وغزل السويس مع فاقوس وأجا مع أسمنت السويس، وفريق الشهداء راحة».وفى المجموعة الخامسة: «المنصورة مع غزل شبين والبادية مع بنى عبيد وديكرنس مع نبروه وبلقاس مع بنهاوطنطا مع الزرقا وسمنود مع شربين وجمهورية شبين مع سرس الليان».وفى المجموعة السادسة: «كفر الشيخ مع دمنهور وسكة حديد طنطا مع كفر الدوار والضبعة مع أبو قير والأوليمبي مع الحمام وكوم حمادة مع مالية كفر الزيات ومطروح مع الزعفران والمياه مع العبور».