أظهرت نتيجة التصنيف العالمي webometrics" الإسباني إصدار يناير 2016"، حصول جامعة بنها على المركز الثالث على مستوى الجامعات المصرية الحكومية بعد جامعتي القاهرة والمنصورة وفي المركز الرابع على 63 جامعة حكومية. وحصلت جامعة بنها على المركز 11 عربيًا وال 14 أفريقيًا وال 1238 عالميًا وهي بذلك متقدمة عن تصنيف يناير 2015، بمركز عربي وبمركزين أفريقيين و181 مركزًا عالميًا، حيث كان ترتيب الجامعة على المركز 12 عربيًا وال16 أفريقيًا وال1419 عالميًا. وأشار الدكتور علي شمس الدين، رئيس الجامعة، أن تصنيف webometrics هو أكبر نظام لتقييم الجامعات العالمية، حيث يغطي أكثر من 25000 ألف جامعة على مستوى العالم، ويصدر في إسبانيا عن المجلس العالي للبحث العلمي، يرتبط بمعيار الأبحاث والملفات الفنية، ويتم تحديثه بشكل دوري كل ستة أشهر، ويتم تصنيف أفضل الجامعات على مستوى العالم على أساس أن نشاطات أي جامعة تظهر في مواقعها الإلكترونية.